Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms