Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccl8Q9Z121 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccl8Q9Z121 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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