Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpk1Q9R0M5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms