Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh2d3cQ9QZS8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms