Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp21Q9QZL6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms