Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VapbQ9QY76 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms