Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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