Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Timp4Q9JHB3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Timp4Q9JHB3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Timp4Q9JHB3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Timp4Q9JHB3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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