Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms