Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riok3Q9DBU3 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms