Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph3bQ9DA80 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph3bQ9DA80 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms