Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Subh2bvQ9D9Z7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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