Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chp2Q9D869 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Chp2Q9D869 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chp2Q9D869 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chp2Q9D869 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chp2Q9D869 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Chp2Q9D869 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chp2Q9D869 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms