Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmigd1Q9D7L8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms