Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MsraQ9D6Y7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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