Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lonrf3Q9D4H7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms