Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms