Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms