Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms