Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ss18l2Q9D174 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ss18l2Q9D174 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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