Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Zbed3Q9D0L1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Zbed3Q9D0L1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Zbed3Q9D0L1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed3Q9D0L1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms