Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfc5Q9D0F6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfc5Q9D0F6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfc5Q9D0F6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfc5Q9D0F6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfc5Q9D0F6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfc5Q9D0F6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfc5Q9D0F6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms