Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Xrcc3Q9CXE6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Xrcc3Q9CXE6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Xrcc3Q9CXE6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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