Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5f1Q9CQQ7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms