Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl35Q9CQL6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms