Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmed6Q9CQG0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms