Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nudt21Q9CQF3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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