Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms