Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms