Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b1Q99NB9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b1Q99NB9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b1Q99NB9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b1Q99NB9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b1Q99NB9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b1Q99NB9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b1Q99NB9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b1Q99NB9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b1Q99NB9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b1Q99NB9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms