Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pagr1aQ99L02 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms