Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ciao1Q99KN2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ciao1Q99KN2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms