Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ctu1Q99J10 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctu1Q99J10 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms