Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TardbpQ921F2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TardbpQ921F2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms