Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms