Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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