Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms