Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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