Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Champ1Q8K327 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Champ1Q8K327 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Champ1Q8K327 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Champ1Q8K327 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Champ1Q8K327 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Champ1Q8K327 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Champ1Q8K327 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Champ1Q8K327 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Champ1Q8K327 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Champ1Q8K327 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms