Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms