Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrebrfQ8CDG5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms