Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RybpQ8CCI5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms