Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms