Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac7Q8C2B3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms