Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ctdsp2Q8BX07 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ctdsp2Q8BX07 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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