Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nop53Q8BK35 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop53Q8BK35 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop53Q8BK35 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop53Q8BK35 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nop53Q8BK35 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nop53Q8BK35 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Nop53Q8BK35 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Nop53Q8BK35 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nop53Q8BK35 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nop53Q8BK35 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nop53Q8BK35 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nop53Q8BK35 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nop53Q8BK35 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Nop53Q8BK35 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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