Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcal1Q8BJL0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms