Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg4bQ8BGE6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms