Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms