Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ttc28Q80XJ3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms